في أوساط الحوزات العلمية طُرقاً مختلفة في تدريس السطوح العالية والقاء البحوث العلمیة ، وكل طريقة من الطرق لها مزاياها ومساو?ها الخاصة بها ، ومن جملة هذه الطرق نذكر الطريقتين الآتيتين :

الأولى : طريقة النص :

وهي الطریقة التي یتم فیها اختیار نص من النصوص المعمقة الفقهیة أو الأصولیة أو غیرها ویتم شرحه والتعل?ق علیه ، ويؤيد هذه الطريقة بعض الأساتذة في تدريس بعض الكتب الجامعة والعميقة في فروع الفقه والأصول (حيث يتم في هذه الطريقة اختيار النص الدراسي بدون دراسة وتركيز) وفي هذه الطريقة تكون مدة التدريس طويلة ، وبسبب صعوبة النص وتعقيده ?ستوحش الطالب ويصبح غير مأنوس بالنسبة للطالب ولا يستفيد منه بصورة صحيحة ؛ لذلك تكون هذه الطريقة بالنسبة إلى طلاب العلم والمعرفة متعبة ومنهكة للقوى .

الثانية : الطريقة الموضوعية (في البحث الخارج) :

وفي هذه الطريقة لا يكون هناك نصاً محدَّداً ، بل يكون البحث منصباً علی الموضوع الذي ?راد بحثه فقط ، ويقوم الأستاذ خلال البحث ببيان رأيه حول ذلك الموضوع بعد تقديم الأدلة و الشواهد والقرائن وكل ما ?دعم البحث و?ضفي عل?ه الصبغة التحق?ق?ة وفي الأثناء تکون مهمة الأستاذ بالدفاع عن رأيه ، ومن جهة أخرى ?عتني باستقبال الإشکال?ات المطروحة من قبل المستمع?ن ، ومن خلالها ?عمق بحثه و?رفع الغموض عن بعض مسائله .

وبالرغم مما لهذه الطريقة من مميزات ؛ لأنها تساعد على تنمية وتربية الطلاب لكنها بمرور الزمن تؤدي إلى طول مدة البحث ، بحيث أن الموضوع الواحد يحتاج بحثه إلى عدة أسابيع ، أو اشهر أو سنوات ، بدون أن يحصل الطالب على ثمرة من البحث .

هذا من جهة ومن جهة اخری هناك مسائل وموضوعات تسللت إلى العلوم الحوزوية ، مثل : بحث موضوع العلم ، الجامد والمشتق ، الصحيح والأعم ، وغيرها أثرت على سير البحوث الأصلية وزادت من حجمها والذي لم يكن هناك دور لهذه المسائل في استنباط الأحكام ، واذا کان لبعضها دور فهو قليل جداً . بالإضافة إلى أنها تأخذ كثيراً من أوقات الفضلاء وطلاب العلوم الدينية .

وهناك مشكلة ینبغي الإشارة إليها ، وهي : انّ انخفاض مستوى دروس البحث الخارج في الوقت الحاضر بسبب الحجم الغفیر من الطلبة في الدرس والتشويش الناتج عن ذلك أدَّى إلى بروز مشاکل عدیدة .

والخبرة التي اكتسبها سماحة آية الله العظمى الجنّاتي خلال نصف قرن من الدراسة والتدريس والتحقيق ، مکنته من تحديد نقاط القوة والضعف في الحوزات العلمية في مدينتي النجف الأشرف وقم المقدسة . واستطاع أن يأتي بطريقة جديدة في التدريس ، فهو في خلال تدريسه لبحوث الخارج فقهاً واصولاً ، ولحفظ وإحياء مميزات الدروس التقليدية في الحوزة ، يؤكد سماحته على اختيار المطالب المهمة ، وحذف المطالب الزائدة التي تأخذ الوقت الكثير ولا فائدة فيها ؛ مراعیاً في ذلك ممیزات الدروس التقلیدیة المتقدمة .

وغالباً ما كان يحثُّ على الأبحاث الأصلية والمفيدة ، والتي تحتوي على مادة عملیة ، كما أن في هذه الطريقة التي يتبعها سماحته يكون قادراً على الدفاع عن نظرياته بصورة مبرمجة و متشخصة المعالم . ويكون طلابه مستعدين لحضور الدرس وقادرین علی النقد والبحث ، فهم بالإضافة إلى تلقیهم الدروس يتعلَّمون أسلوب ومنهجیة الإجتهاد والطریقة الصحیحة لوضع النظريات .

ومن المميزات الأخرى لطريقة سماحة آية الله العظمى الجنّاتي في التدريس ، هي أنه يجعل للطالب محوریة الدرس ولا یقتصر علی القاء الدرس ویکون دور الطالب هو دور المستمع لا غیر . فهو يعطي المجال الواسع للطالب لان یعرض ارائه و اشکالیاته ومطارحات فکره ، بالإضافة إلى تعلیمه الطرق العملية لاستنباط الأحكام الشرعية وجزئياتها في كل مسألة مع تفريعاتها .

وبعبارة أدقّ : إن منهجیة درسه هي منهجیة تلفیقیة تجمع بين الطريقة التقليدية والطريقة الحديثة ، وهذه الطريقة تساعد على تربية الطالب ولها الأثر الكبير في أوساط الحوزة . وفي الواقع أن هذه الطريقة قد شیدها سماحته في دروسه التعلیمیة ويعتبرها خطوة على طريق إصلاح النظام الدراسي في الحوزة العلمیة .

وجدير بالذكر أن لسماحة آية الله العظمى الجنّاتي مشروع جديد في إصلاح طرق التدريس في الحوزة قد تم توضیحها في محلها .